: 複数の原子の編集
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目次
原子の属性変更
原子の座標や原子種, 構造緩和の際に``可動か否か''といった編集は, 図 8.24に図示する, 「原子属性エディター」上
で行うことができます.
この画面を起動するには, まず目的の原子を選択状態とし(第 8.5.2節), 左クリックをしてください.
この画面上で編集できる項目を説明します.
- element
- このリストから原子種を選択することができます.
- rx
座標を入力します. 単位はÅです.
- ry
座標を入力します. 単位はÅです.
- rz
座標を入力します. 単位はÅです.
- mobile
- 構造緩和や分子動力学計算を行う際に, 対応する原子を動かしたい場合有効にします.
- weight
- 反転対称性のある系の場合, 反転操作の対象となる原子は``2'', それ以外の場合は``1''とします.
- aldos
- 原子分割局所状態密度を計算する場合, 対応する原子の局所状態密度を計算する場合有効にします.
- num_layer
- 層分割局所状態密度を計算する場合, 対応する原子が属する層のIDを入力します.
- thermo_group
- 温度制御分子動力学シミュレーションを行う際, 対応する原子が属する熱浴のIDを入力します.
jkoga
平成22年4月27日